Les principaux aéroports de Estonie sont : Lennart Meri Tallinn Airport (TLL), Kuressaare Airport (URE), Kärdla Airport (KDL), Pärnu Airport (EPU), Tartu Airport (TAY). Au total, Estonie compte 34 aéroports et 10 héliports (CIA World Factbook). Le dossier transport complet — ports, voies ferrées, pipelines — est sur sa fiche pays du Factbook Magna ci-dessous.
| Aéroport — ville | IATA |
|---|---|
| <strong>Lennart Meri Tallinn Airport</strong> — Tallinn | TLL |
| <strong>Kuressaare Airport</strong> — Kuressaare | URE |
| <strong>Kärdla Airport</strong> — Kärdla | KDL |
| <strong>Pärnu Airport</strong> — Pärnu | EPU |
| <strong>Tartu Airport</strong> — Tartu | TAY |
